1997年6月重慶直轄市設立后，在原四川省涪陵市人民檢察院的基礎上，組建設立了重慶市人民檢察院第三分院（機關地址：重慶市涪陵區(qū)太極大道63號）。下轄涪陵區(qū)、南川區(qū)、武隆區(qū)、墊江縣、豐都縣等5個基層院。轄區(qū)面積1.12萬平方公里，人口360萬，2016年地區(qū)生產(chǎn)總值1684億元。